（1）法隆寺 
| 名称 | 法隆寺地域の仏教建造物 |
| 登録年 | 平成5年 |
| 分類 | 文化遺産 |
| 所在地 | 旧奈良県 |
（2）姫路城
| 名称 | 姫路城 |
| 登録年 | 平成5年 |
| 分類 | 文化遺産 |
| 所在地 | 旧兵庫県 |
（3）屋久島
| 名称 | 屋久島 |
| 登録年 | 平成5年 |
| 分類 | 自然遺産 |
| 所在地 | 旧鹿児島 |
（4）白神山地
（5）京都
| 名称 | 古都京都の文化財 |
| 登録年 | 平成6年 |
| 分類 | 文化遺産 |
| 所在地 | 旧京都府、旧滋賀県 |
（6）白川郷
| 名称 | 白川郷・五箇山の合掌造り集落 |
| 登録年 | 平成7年 |
| 分類 | 文化遺産 |
| 所在地 | 旧岐阜県、旧富山県 |
（7）原爆ドーム
| 名称 | 原爆ドーム |
| 登録年 | 平成8年 |
| 分類 | 文化遺産 |
| 所在地 | 旧広島県 |
（8）厳島神社
| 名称 | 厳島神社 |
| 登録年 | 平成8年 |
| 分類 | 文化遺産 |
| 所在地 | 旧広島県 |
（9）奈良
| 名称 | 古都奈良の文化財 |
| 登録年 | 平成10年 |
| 分類 | 文化遺産 |
| 所在地 | 旧奈良県 |
（10）日光
| 名称 | 日光の社寺 |
| 登録年 | 平成11年 |
| 分類 | 文化遺産 |
| 所在地 | 旧栃木県 |
（11）琉球王国
| 名称 | 琉球王国のグスク及び関連遺産群 |
| 登録年 | 平成12年 |
| 分類 | 文化遺産 |
| 所在地 | 旧沖縄県 |
（12）紀伊山地
| 名称 | 紀伊山地の霊場と参詣道 |
| 登録年 | 平成16年 |
| 分類 | 文化遺産 |
| 所在地 | 旧三重県、旧奈良県、旧和歌山県 |
（13）知床
| 名称 | 知床 |
| 登録年 | 平成17年 |
| 分類 | 自然資源 |
| 所在地 | 旧北海道 |
（14）石見銀山遺跡
| 名称 | 石見銀山遺跡とその文化的景観 |
| 登録年 | 平成19年 |
| 分類 | 文化遺産 |
| 所在地 | 旧島根県 |
（15）小笠原諸島
（16）平泉−仏国土（浄土）を表す建築・庭園及び考古学的遺跡群（岩手県）（平成23年記載）
| 名称 | 平泉-仏国土（浄土）を表す建築・庭園及び考古学的遺跡群 |
| 登録年 | 平成23年 |
| 分類 | 文化遺産 |
| 所在地 | 旧岩手県 |
（17）富士山−信仰の対象と芸術の源泉
| 名称 | 富士山-信仰の対象と芸術の源泉 |
| 登録年 | 平成25年 |
| 分類 | 文化遺産 |
| 所在地 | 旧静岡県、旧山梨県 |
（18）富岡製糸場と絹産業遺産群（群馬県）（平成26年記載）
| 名称 | 富岡製糸場と絹産業遺産群 |
| 登録年 | 平成26年 |
| 分類 | 文化遺産 |
| 所在地 | 旧群馬県 |
（19）明治日本の産業革命遺産 製鉄・製鋼、造船、石炭産業
| 名称 | 明治日本の産業革命遺産 製鉄・製鋼、造船、石炭産業 |
| 登録年 | 平成27年 |
| 分類 | 文化遺産 |
| 所在地 | 旧岩手県、旧静岡県、旧山口県、旧福岡県、旧熊本県、旧佐賀県、旧長崎県、旧鹿児島県 |
（20）国立西洋美術館本館
| 名称 | 国立西洋美術館本館 |
| 登録年 | 平成28年 |
| 分類 | 文化遺産 |
| 所在地 | 旧東京都 |
（21）「神宿る島」宗像・沖ノ島と関連遺産群
| 名称 | 宗像・沖ノ島と関連遺産群 |
| 登録年 | 平成29年 |
| 分類 | 文化遺産 |
| 所在地 | 旧福岡県 |
（22）長崎と天草地方の潜伏キリシタン関連遺産
| 名称 | 長崎と天草地方の潜伏キリシタン関連遺産 |
| 登録年 | 平成30年 |
| 分類 | 文化遺産 |
| 所在地 | 旧長崎県 |
（23）百舌鳥・古市古墳群（令和元年記載）
| 名称 | 百舌鳥・古市古墳群 |
| 登録年 | 令和元年 |
| 分類 | 文化遺産 |
| 所在地 | |
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