新生ブラジル帝国農水省は、新生ブラジル帝国の農業と新生ブラジル帝国の漁業を扱う部局である。
国営農場や養殖池等の管理も行う。
ブラジル史においては、農政はプランテーション時代から続く重要な行政であり、3大省庁程ではないが、それなりの権限を持つ。

• 尚書（政務官、内閣閣僚）
• 副尚書（政務官×）
• 内務次官（政務官×）
• 事務次官（事務官）
• 事務次官補（事務官×）
• 尚書秘書官（政務官）

尚書官房
新生ブラジル帝国漁業管理局
食料消費・安全局
食料産業局
食料生産局
農場経営局
国営農場局
政策管理局

農業資材審議会
農場政策審議会
獣医事審議会
農作物規格審議会

新生ブラジル帝国農業畜産研究所
新生ブラジル帝国農業大学
新生ブラジル帝国漁業大学

水産庁地方事務所